产品能力

让一项研究,从数据走到结果

公共数据与上传、内置分析与自定义流程、任务进度与报告,都在同一工作区。

每个环节都有下一步

同一套运行向导

内置分析、自建流程和迁入项目统一选择数据、参数和运行设置。

知道任务进行到哪里

查看当前阶段、处理步骤和日志;发生问题时,从对应分析继续处理。

报告连接到分析结果

打开流程生成的报告,下载结果文件,并核对当次输入与参数。

助手跟随研究上下文

让 Copilot 帮助找数据、整理配置和理解结果,重要动作先给出摘要。

流程可以改版与复用

基于模板或工具搭建自己的流程,保存版本,为下一批数据复用。

数据和样本集中管理

上传文件、维护样本信息、添加公共数据,在运行时按输入要求选择。

从首次运行,到自己的研究流程

基础操作保持一致,进阶能力按需要展开。

流程构建与迁入

用兼容工具搭建分析步骤,或上传 ZIP、从 Git 迁入已有 Nextflow DSL2 项目。原生项目保留源码结构,导入时检查运行兼容性。

得到可管理版本的个人流程;在统一运行页选择本次数据和参数。

迁入 Nextflow 项目

六类内置分析

基于 nf-core 流程,按研究对象和输入数据选择。报告内容取决于具体分析与参数。

RNA-seq 转录组

nf-core/rnaseq

支持多种比对器与定量方法,包含全面的质控与基因 / 转录本水平定量分析。

常见产物:表达定量矩阵、比对统计与质控报告。

在平台中选择分析

ChIP-seq

nf-core/chipseq

分析蛋白与 DNA 相互作用的测序数据,完成比对、峰识别与质量评估。

常见产物:峰区间、覆盖度文件与质控报告。

在平台中选择分析

ATAC-seq

nf-core/atacseq

用于染色质可及性研究,检测开放染色质区域与调控元件。

常见产物:开放染色质区间、覆盖度与质控报告。

在平台中选择分析

Sarek 变异检测

nf-core/sarek

支持 WGS / WES 数据的 germline 与 somatic 变异分析及功能注释。

常见产物:变异文件、相关注释和质控结果,依所选步骤生成。

在平台中选择分析

Methyl-seq 甲基化

nf-core/methylseq

支持 WGBS 与 RRBS 数据的全基因组甲基化水平分析。

常见产物:甲基化位点结果、覆盖度与质控报告。

在平台中选择分析

空间转录组

nf-core/spatialvi

10x Genomics Visium 空间转录组学分析,支持 Space Ranger 与下游分析。

常见产物:空间表达结果及流程生成的报告,依输入和参数生成。

在平台中选择分析

研究者掌握配置,平台负责运行

Nextflow 编排分析步骤,平台连接输入、计算、输出与运行记录。

研究工作区

选择数据、配置分析、跟踪任务、阅读报告

Nextflow 分析执行

按流程依赖组织计算步骤,使用固定的流程与工具版本

数据与计算基础

存储输入和结果,调度计算资源,保留每次分析的运行信息

AI 助手

让 Copilot 帮你推进下一步

从研究问题到数据和分析配置,助手提供建议与行动摘要。关键选择由你掌握。

打开 Copilot

从论文和问题找到入口

整理研究方向,查找相关数据和分析方法,保留可以追查的来源。

辅助配置一次分析

结合已有数据与流程补全配置,提示缺失的输入;启动前查看运行摘要。

理解任务状态和结果

了解当前在做什么、为何受阻,并结合已生成的报告讨论下一步研究。

数据、分析与报告,放在同一工作区

从你的下一项分析开始

选择内置分析、添加数据,再确认运行设置。已有 Nextflow 项目也可以从导入入口继续。

让一项研究,从数据走到结果 · GeniOmics